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海洋学院尹绍武教授课题组在《Molecular & Cellular Proteomics》宣布杂交黄颡鱼“黄优1号”杂种优势分子遗传机制的研讨效果

近来,继我校海洋学院尹绍武课题组成功培育出杂交黄颡鱼“黄优1号”(GS-02-001-2018)国家级水产新品种后,课题组又提醒了杂交黄颡鱼“黄优1号”杂种优势构成的分子遗传机制。相关研讨效果以“Integrated analysis of transcriptomic, miRNA and proteomic changes of a novel hybrid yellow catfish uncovers key roles for miRNAs in heterosis”为题在世界闻名学术期刊Molecular & Cellular Proteomics在线宣布。Molecular & Cellular Proteomics是世界蛋白组学尖端期刊,5年归纳影响因子为6.324。

杂交优势的使用已成为进步鱼产值和改善鱼质量的重要途径,已经在实践中得到了广泛使用,而对其分子遗传机制的研讨相比之下仍处于萌发阶段。可以说咱们对鱼类杂种优势的使用速度已远远超前了对其理论水平的知道,这在必定程度上也约束了杂种优势在鱼类饲养业中更好的使用。杂交黄颡鱼“黄优1号”具有成长速度快、抗病才能强、耐运送等长处,为了充分使用杂种优势培育黄颡鱼饲养优良品种,该研讨运用mRNA-seq、miRNA-seq、蛋白质组、Parallel reaction monitoring(PRM)等测序技能从转录、转录后和蛋白质水平全体地研讨杂交种及其亲本间基因和蛋白质的差异表达及改变规则,针对杂交优势调控相关miRNA与杂交种靶基因的调控联系进行剖析,然后归纳解析了杂交黄颡鱼“黄优1号”杂种优势的分子遗传机制。

该研讨结果显现:(1)mRNA-seq、miRNA-seq、蛋白质组共判定出57,510个基因,818个miRNA和4,528个蛋白。(2)杂交黄颡鱼“黄优1号”具有高份额的非加性表达基因/miRNA/蛋白,显着富集KEGG标明首要参加免疫防护,抗氧化才能,代谢(维生素、氨基酸、脂类和碳水化合物)以及消化和吸收。(3)杂交黄颡鱼“黄优1号”和两个亲本(M和F)之间差异表达的基因/miRNA/蛋白质的百分比是不对称的,M和F之间的DEG、DEM和DEP显着高于M-H和F-H,提示杂交黄颡鱼“黄优1号”亲本同源基因表达偏倚(HEB)和表达水平优势(ELD)遗传形式。(4)比较亲本和杂交黄颡鱼“黄优1号”的11,789个同源基因的特异性SNP,显现杂种H中95.4%的同源物特异性SNP基因具有F/M偏倚(HEB)。(5)高份额ELD形式基因/miRNA/蛋白的KEGG富集剖析显现成长发育、摄食调节、代谢才能和维生素代谢、消化系统、细胞增殖、免疫防护和抗氧化才能等在杂交优势构成中具有重要作用。(6)联合互作剖析取得121个miRNA-mRNA-蛋白pairs,并针对具有代表性的6个miRNA-mRNA-蛋白pairs进行了qRT-PCR和PRM剖析验证,发现这些pairs参加杂交黄颡鱼“黄优1号”的生物体发育(miR-27a-Camk2d1)、代谢(miR-30e-ACOT6和miR-181a-Retsat)、免疫应对(miR-221-Cfi和miR-130c-CHL1)、消化和吸收(miR-140-Abcb11)。

该研讨效果不仅对鱼类杂种优势的有用使用和鲿科鱼类杂交育种研讨具有重要的理论含义和实用价值,并且对往后解析其他鱼类的杂种优势遗传机理研讨具有重要的学习和指导作用。

海洋学院尹绍武教授为该文通讯作者,2012级结业的博士生张国松为榜首作者。该研讨得到江苏省要点研讨方案(现代农业)要点项目等项目的赞助。

论文链接:

https://www.mcponline.org/content/early/2019/05/15/mcp.RA118.001297

  • 更新时刻

    2019年05月28日

  • 阅览量

  • 供稿

    海洋学院

南京市大学城文苑路1号,
邮编 210023
[email protected]

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